百香果因生长速度较快，故推荐种植者在植株生长期、结果期和采收之后三个时期对植株进行修剪。植株生长期的修剪应注意均匀分布侧蔓。对于过密的藤蔓，要进行着情疏除修剪注意透风透光。花果期的修剪一般在每批果采收后，每个侧蔓短截三至四节，为新的侧蔓留出生长空间。采收后的修剪应保留二至三节的果枝基部，能促进其新结果枝从基部萌发出来，同时及时地剪去枯枝、残枝、病虫枝等，便于来年生长。
1、植株生长期：当百香果处于生长期时，应适当引导主蔓、将多余侧枝的进行修剪，通常留1-2条主蔓上架，剪去多余侧枝。待主蔓长到一定程度时剪除顶芽，每侧留2个侧蔓，再剪去侧蔓的顶部。这样能让植株生长出更多的侧蔓。培育出健壮的侧蔓，有利于提高产量。
2、植株花果期：百香果一般每批果丰收后，对每个侧蔓进行短截，以利于枝干中长出新的侧蔓。同时夏季是植物的花果期，为了提高通风透气性，还需要疏剪生长过于集中的枝条，垂至地面的枝条也要进行进行修剪，保证枝条离地面大约20-30厘米高即可。
3、植株采收后：在收获完最后一批果实后，需要以主枝为中心，修剪两侧的枝条，侧枝留50厘米左右即可。修剪完后要注意加固棚架，注意预防病虫害，特别是茎基腐病。
